http://www.tuxradar.com/content/build-your-own-linux-distribution-easy-way z.b. als Einstieg zu empfehlen.
Ich hab mir damals als "Unterbau" nen Linux from Scratch hochgezogen, hab viel dabei gelernt.
Edit: Unter anderem, dass es es manchmal die Mühe nur bedingt wert ist, das Rad neu erfinden...